Preview

Опухоли женской репродуктивной системы

Расширенный поиск

Открытие потенциальных биомаркеров рака яичников масс-спектрометрическим профилированием низкомолекулярного протеома плазмы крови

https://doi.org/10.17650/1994-4098-2013-0-3-4-90-96

Полный текст:

Аннотация

В настоящее время нет скринингового теста для раннего детектирования и мониторинга рака яичников (РЯ) – одной из на- иболее летальных форм гинекологических злокачественных опухолей. В этом исследовании разработана, унифицирована и апробирована новая методология поиска биомаркеров РЯ, основанная на профилировании низкомолекулярного протеома плаз- мы крови. Данный подход включает 3 основных компонента: предварительную подготовку образцов, времяпролетную масс- спектрометрию с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией, обработку данных с помощью биоинформаци- онного пакета программ. Продемонстрированы возможности и перспективность разработанного подхода для обнаружения потенциальных маркеров РЯ. Проведен скрининг 40 образцов плазмы крови больных РЯ и 48 контрольных образцов. В резуль- тате проведенного исследования обнаружены пептиды/полипептиды, которые могут в перспективе использоваться для де- тектирования этой патологии.

Об авторах

В. Е. Шевченко
Лаборатория онкопротеомики ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


Н. Е. Арноцкая
Лаборатория онкопротеомики ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


Е. В. Огородникова
отделение переливания крови с банком костного мозга ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


Н. Р. Погосян
гинекологическое отделение ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


А. Н. Грицай
гинекологическое отделение ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


К. И. Жорданиа
гинекологическое отделение ФГБУ «РОНЦ им. Н.Н. Блохина» РАМН, Москва
Россия


Список литературы

1. Permuth-Wey J., Sellers T.A. Epidemiology of ovarian cancer. Methods Mol Biol 2009;472:413–37.

2. Шевченко В.Е., Арноцкая Н.Е., Макаров Д.Е. и др. Протеомика в диагностике рака яичников. Опухоли женской репродуктивной системы 2011;(2):56–64.

3. Rai A.J., Zhang Z., Rosenzweig J. et al. Proteomic approaches to tumor marker discovery. Arch Pathol Lab Med 2002;126(12):1518–26.

4. Tung C.S., Wong K.K., Mok S.C. Biomarker discovery in ovarian cancer. Womens Health (Lond Engl) 2008;4:27–40.

5. Jackson D., Craven R.A., Hutson R.C. et al. Proteomic profiling identifies afamin as a potential biomarker for ovarian cancer. Clin Cancer Res 2007;13(24):7370–9.

6. Шевченко В.Е. Современные масс-спектрометрические методы в ранней диагностике рака. Масс-спектрометрия 2004;1(2):103–26.

7. Etzioni R., Urban N., Ramsey S. et al. The case for early detection. Nat Rev Cancer 2003;3(4):243–52.

8. Aldred S., Grant M.M., Griffiths H.R. The use of proteomics for the assessment of clinical samples in research. Clin Biochem 2004;37(11):943–52.

9. Banks R.E., Dunn M.J., Hochstrasser D.F. et al. Proteomics: new perspectives, new biomedical opportunities. Lancet 2000;356(9243):1749–56.

10. Diamandis E.P. Proteomic patterns in serum and identification of ovarian cancer. Lancet 2002;360(9327):170.

11. Guillaume E., Zimmermann C., Burkhard P.R. et al. A potential cerebrospinal fluid and plasmatic marker for the diagnosis of Creutzfeldt-Jakob disease. Proteomics 2003;3(8):1495–9.

12. Howard B.A., Wang M.Z., Campa M.J. et al. Identification and validation of a potential lung cancer serum biomarker detected by matrix- assisted laser desorption/ionization-time of flight spectra analysis. Proteomics 2003;3(9):1720–4.

13. Koopmann J., Zhang Z., White N. et al. Serum diagnosis of pancreatic adenocarcinoma using surface-enhanced laser desorption and ionization mass spectrometry. Clin Cancer Res 2004;10(3):860–8.

14. Menon U., Jacobs I. Screening for ovarian cancer. Best Pract Res Clin Obstet Gynaecol 2002;16(4):469–82.

15. Petricoin E.F., Ardekani A.M., Hitt B.A. et al. Use of proteomic patterns in serum to identify ovarian cancer. Lancet 2002;359(9306):572–7.

16. Zheng P.P., Luider T.M., Pieters R. et al. Identification of tumor-related proteins by proteomic analysis of cerebrospinal fluid from patients with primary brain tumors. J Neuropathol Exp Neurol 2003;62(8):855–62. 17. Whiteley G.R., Colantonio S., Sacconi A., Saul R.G. Analytical considerations for mass spectrometry profiling in serum biomarker discovery. Clin Lab Med 2009;29(1):57–69.

17. Baggerly K.A., Morris J.S., Edmonson S.R., Coombes K.R. Signal in noise: evaluating reported reproducibility of serum proteomic tests for ovarian cancer. J Natl Cancer Inst 2005;97(4):307–9.

18. Kristina G., Radomir P., Eva B. et al. When one chip is not enough: augmenting the validity of SELDI-TOF proteomic profiles of clinical specimens. Lab Chip 2009;9(7):1014–17.

19. Шевченко В.Е., Арноцкая Н.Е., Трифонова О.П. и др. Профилирование низкомолекулярного протеома плазмы крови для обнаружения потенциальных маркеров рака легкого. Масс-спектроме- трия 2007;4(4):245–54.

20. Shevchenko V.E., Arnotskaya N.E., Zaridze D.G. Detection of lung cancer using plasma protein profiling by matrix-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry. Eur J Mass Spectrom (Chichester, Eng) 2010;16(4):539–49.

21. Пятницкий М.А., Лисица А.В., Шевченко В.Е. и др. Выявление дифференциальных признаков плоскоклеточного рака легкого с помощью масс-спектрометрического профилирования плазмы крови. Масс-спектрометрия 2011;8(2):99–105.

22. Villanueva J., Shaffer D.R., Philip J. et al. Differential exoprotease activities confer tumor-specific serum peptidome patterns.J Clin Invest 2006;116(1):271–84.

23. Ketterlinus R., Hsieh S.Y., Teng S.H. et al. Fishing for biomarkers: analyzing mass spectrometry data with the new ClinProTools software. Biotechniques 2005;(Suppl):37–40.

24. Сорокина А.В., Радзинский В.Е., Мус- тафина Е.А. и др. Масс-спектрометрия – новый подход в диагностике аденомиоза и рака тела матки. Опухоли женской репродуктивной системы 2011;(2):65–72.

25. Шевченко В.Е., Мадина Х., Поддубная И.В. и др. Массспектрометрическое профилирование низкомолекулярного протеома плазмы крови для обнаружения потенциальных маркеров рака молочной железы. Вестн РОНЦ 2011;22(3):27–33.

26. Zhou M., Lucas D.A., Chan K.C. et al. An investigation into the human serum «interactome». Electrophoresis 2004;25(9):1289–98.

27. Callesen A.K., Mogensen O., Jensen A.K. et al. Reproducibility of mass spectrometry based protein profiles for diagnosis of ovarian cancer across clinical studies: A systematic review. J Proteomics 2012;75(10):2758–72.

28. Fiedler G.M., Baumann S., Leichtle A. et al. Standardized peptidome profiling of human urine by magnetic bead separation and matrix- assisted laser desorption/ionization time-of- flight mass spectrometry. Clin Chem 2007;53(3):421–8.

29. Schaub N.P., Jones K.J., Nyalwidhe J.O. et al. Serum proteomic biomarker discovery reflective of stage and obesity in breast cancer patients. J Am Coll Surg 2009;208(5):970–8.

30. Schwamborn K., Krieg R.C., Grosse J. et al. Serum proteomic profiling in patients with bladder cancer. Eur Urol 2009;56(6):989–96.


Для цитирования:


Шевченко В.Е., Арноцкая Н.Е., Огородникова Е.В., Погосян Н.Р., Грицай А.Н., Жорданиа К.И. Открытие потенциальных биомаркеров рака яичников масс-спектрометрическим профилированием низкомолекулярного протеома плазмы крови. Опухоли женской репродуктивной системы. 2013;(3-4):90-96. https://doi.org/10.17650/1994-4098-2013-0-3-4-90-96

For citation:


Shevchenko V.E., Arnotskaya N.E., Ogorodnikova E.V., Pogosyan N.R., Gritsay A.N., Zhordania K.I. Discovery of potential ovarian cancer biomarkers using low molecular weight blood plasma proteome profiling by mass spectrometry. Tumors of female reproductive system. 2013;(3-4):90-96. (In Russ.) https://doi.org/10.17650/1994-4098-2013-0-3-4-90-96

Просмотров: 192


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1994-4098 (Print)
ISSN 1999-8627 (Online)